Il y a 2 écoles d'enseignement spécialisé à la COCOF: l'Institut Alexandre Herlin (maternel, primaire et secondaire) et l'Institut Charles Gheude (secondaire).
L’Institut Alexandre Herlin est composé d'une section fondamentale et d'une section secondaire. Il accueille des élèves déficients mentaux modérés (type 2), déficients visuels (type 6), déficients auditifs (type 7), dysphasiques (T7 Dys) et atteints de troubles instrumentaux (type 8).
L'Institut Charles Gheude est une école secondaire spécialisée pour les enfants avec des difficultés d’apprentissage, un handicap moteur ou sensoriel. Elle propose à ses élèves un enseignement leur permettant de s'épanouir et guide les jeunes vers la réussite.